Hồng y Gioan Baotixita Phạm Minh Mẫn được tấn phong năm 1993, thời Giáo hoàng Gioan Phaolô II, bởi:[5]

• Giám mục chủ phong: Giám mục chính tòa Giáo phận Cần Thơ Emmanuel Lê Phong Thuận
• Hai giám mục phụ phong: Giám mục Phanxicô Xaviê Nguyễn Quang Sách – giám mục chính tòa Giáo phận Đà Nẵng; Giám mục Giuse Nguyễn Quang Tuyến – giám mục phó Giáo phận Bắc Ninh.

Hồng y Gioan Baotixita Phạm Minh Mẫn là giám mục chủ phong cho các giám mục:[5]

• Năm 1999, Tân giám mục chính tòa Giáo phận Mỹ Tho Phaolô Bùi Văn Đọc, nay là cố Tổng giám mục đô thành Tổng giáo phận Thành phố Hồ Chí Minh.
• Năm 2001, Tân giám mục phụ tá Tổng giáo phận Thành phố Hồ Chí Minh Giuse Vũ Duy Thống, nay là cố giám mục chính tòa Giáo phận Phan Thiết.
• Năm 2008, Tân giám mục phụ tá Tổng giáo phận Thành phố Hồ Chí Minh Phêrô Nguyễn Văn Khảm, nay là giám mục chính tòa Giáo phận Mỹ Tho.